47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1193 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 505 aa  1025    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.05 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.7 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.6 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.11 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.95 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  40 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  27.6 
 
 		 979 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.43 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.18 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.18 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.94 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  30.19 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  24.33 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5945  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.15 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  36.49 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  25.09 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.77 
 
 		 375 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  25.2 
 
 		 383 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  24.51 
 
 		 400 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2370  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.62 
 
 		 373 aa  53.9  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0553875  normal  0.0113185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.52 
 
 		 423 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 366 aa  53.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0253  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.11 
 
 		 368 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  31.67 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  25.82 
 
 		 384 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 3172 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 3301 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  31.58 
 
 		 386 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3001  hypothetical protein  23.43 
 
 		 521 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3672  hypothetical protein  21.5 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43765  normal  0.291983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.72 
 
 		 630 aa  50.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  58.54 
 
 		 2342 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  58.54 
 
 		 2342 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4960  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.66 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1814  hypothetical protein  23.27 
 
 		 362 aa  47.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.506376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  19.85 
 
 		 360 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5460  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.33 
 
 		 365 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.65 
 
 		 844 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  27.55 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.22 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.76 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.58 
 
 		 338 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2006  hypothetical protein  35.29 
 
 		 339 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 1313 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 1322 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0099  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  28.79 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>