53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4330 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 487 aa  1012    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.95 
 
 		 630 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  29.05 
 
 		 379 aa  106  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.76 
 
 		 338 aa  103  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1814  hypothetical protein  25.16 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.506376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.02 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.02 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.77 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 3301 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 3172 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.44 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.65 
 
 		 844 aa  78.2  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.1 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  27.1 
 
 		 979 aa  73.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.27 
 
 		 595 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6689  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.43 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  27.4 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.94 
 
 		 630 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2350  hypothetical protein  25.7 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0908976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  25.25 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.73 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3778  hypothetical protein  26.26 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.22 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.7 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  22.69 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3001  hypothetical protein  24.87 
 
 		 521 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.79 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  33.09 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.44 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  21.85 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0253  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.15 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5460  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  24.75 
 
 		 398 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5945  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.23 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1593  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.11 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0705  hypothetical protein  25.11 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4960  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.7 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.03 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  24.47 
 
 		 384 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6306  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.11 
 
 		 350 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  23.08 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  35.21 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3856  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.49 
 
 		 376 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.347338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4404  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.33 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.59 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.33 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  27.5 
 
 		 381 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  31.25 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.76 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  27.12 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>