55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2424 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  100 
 
 
360 aa  722    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  45.88 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.35 
 
 
423 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  31.08 
 
 
979 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.86 
 
 
423 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 
3301 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
3172 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.85 
 
 
595 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.49 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  20.06 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.61 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2370  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.36 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0553875  normal  0.0113185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.31 
 
 
630 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  24.14 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.61 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  30.07 
 
 
349 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  28.08 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  20.83 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.3 
 
 
414 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  21.41 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.42 
 
 
414 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  24.53 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.03 
 
 
493 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01531  hypothetical protein  25.79 
 
 
380 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0705  hypothetical protein  19.67 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  31.63 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0099  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  28.19 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.74 
 
 
630 aa  59.3  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.85 
 
 
487 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6306  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.3 
 
 
350 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.81 
 
 
426 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3267  hypothetical protein  21.02 
 
 
383 aa  56.6  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.47 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.58 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.58 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3001  hypothetical protein  25.64 
 
 
521 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.489823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.93 
 
 
398 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.21 
 
 
440 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  26.72 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1593  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.31 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  28 
 
 
400 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0344  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.49 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.422128  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  25.76 
 
 
1213 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  23.35 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.29 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3672  hypothetical protein  21.85 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43765  normal  0.291983 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2182  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  33.33 
 
 
451 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  19.85 
 
 
505 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6689  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.03 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3856  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.05 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.347338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3813  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  20.7 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00975  hypothetical protein  34.38 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480746  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.58 
 
 
844 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30 
 
 
338 aa  42.7  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>