35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01531 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_01531  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  27.03 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.33 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.4 
 
 
979 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.28 
 
 
423 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
3301 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
3172 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.6 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  25.79 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.45 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  23.94 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  21.46 
 
 
366 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3813  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  19.85 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0099  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.89 
 
 
351 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  22.12 
 
 
374 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.06 
 
 
493 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2370  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  20.3 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0553875  normal  0.0113185 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  18.93 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.79 
 
 
630 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  20.72 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.54 
 
 
378 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.03 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  19.74 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.13 
 
 
386 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5945  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.87 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  21.21 
 
 
383 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.8 
 
 
338 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  19.81 
 
 
440 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.47 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4404  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  44.19 
 
 
456 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>