53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5189 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 
423 aa  874    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  49.27 
 
 
423 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  37.24 
 
 
979 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 
3172 aa  179  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
3301 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.53 
 
 
407 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  29.52 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3672  hypothetical protein  26.87 
 
 
434 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43765  normal  0.291983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2370  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.6 
 
 
373 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0553875  normal  0.0113185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  26.35 
 
 
360 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  29.62 
 
 
366 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  28.57 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.34 
 
 
375 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  24.66 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  22.77 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  28.7 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  29 
 
 
418 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  40.57 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.62 
 
 
440 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.81 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  26.07 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6306  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.88 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  24.9 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  31.98 
 
 
1213 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.06 
 
 
595 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4960  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.97 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3813  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.47 
 
 
306 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  22.45 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.37 
 
 
630 aa  62.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 
372 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01531  hypothetical protein  22.45 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.14 
 
 
844 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.84 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.84 
 
 
378 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.79 
 
 
487 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5945  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.14 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0344  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  28.48 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.422128  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.29 
 
 
426 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.84 
 
 
630 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.63 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.59 
 
 
338 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.41 
 
 
414 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.41 
 
 
414 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6689  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30 
 
 
391 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  24.19 
 
 
379 aa  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28422  predicted protein  27.88 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28498  predicted protein  27.88 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.22 
 
 
505 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0991  hypothetical protein  27.73 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.569438  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00975  hypothetical protein  34.43 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>