52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4250 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 398 aa  823    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.65 
 
 		 595 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6306  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.07 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.74 
 
 		 414 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.08 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.52 
 
 		 426 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5945  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.81 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.59 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  26.39 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2370  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.15 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0553875  normal  0.0113185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.44 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.44 
 
 		 630 aa  75.5  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  28.4 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.01 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 979 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.81 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  31.98 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.03 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  32.17 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  28.11 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 3172 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  23.64 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 3301 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  29.25 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.95 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4960  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.41 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.37 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  26.82 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  36.96 
 
 		 630 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  23.67 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.69 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.17 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.55 
 
 		 844 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0099  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.12 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3672  hypothetical protein  29.45 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43765  normal  0.291983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  25.93 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  31.68 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.28 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6689  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.55 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  23.85 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  28.97 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.81 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.93 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3001  hypothetical protein  26.72 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  22.11 
 
 		 1213 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1814  hypothetical protein  24 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.506376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0705  hypothetical protein  28.57 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  22.71 
 
 		 509 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0253  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.1 
 
 		 368 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>