43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1056 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  86.75 
 
 		 416 aa  760    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  861    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  28.8 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  32.38 
 
 		 304 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  35.05 
 
 		 349 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  35.32 
 
 		 289 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  33.2 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 281 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  31.68 
 
 		 412 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  33.47 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  34.55 
 
 		 248 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  28.62 
 
 		 787 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  27.24 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  29.29 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  27.53 
 
 		 600 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  30.18 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  28.32 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  23.62 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  27.44 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  29.47 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  26.24 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  28.42 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.64 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  27.98 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  27.78 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  31.45 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  30.65 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  31.82 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48287  predicted protein  30.4 
 
 		 839 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48279  predicted protein  30.4 
 
 		 839 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44250  predicted protein  31.48 
 
 		 871 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3179  hypothetical protein  28.38 
 
 		 328 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2953  hypothetical protein  27.93 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105956 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  26.83 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1512  hypothetical protein  30.7 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  32.98 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  32.29 
 
 		 328 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0220  hypothetical protein  27.86 
 
 		 336 aa  47  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 677 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0073  hypothetical protein  31.19 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.56225e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 992 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 257 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  25.76 
 
 		 338 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>