18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2953 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3179  hypothetical protein  96.95 
 
 		 328 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2953  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1197  hypothetical protein  35.94 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.5811  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3927  hypothetical protein  41.67 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.718732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1512  hypothetical protein  37.5 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0023  tetratricopeptide TPR_2  45.45 
 
 		 193 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 826 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 785 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  27.93 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1288  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1521  hypothetical protein  25.86 
 
 		 278 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.64 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5783  hypothetical protein  26.8 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  26.32 
 
 		 787 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  32.29 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>