45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0541 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 416 aa  863    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  86.75 
 
 		 416 aa  760    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  38.02 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  28 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  31.21 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  35.32 
 
 		 289 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  32.81 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  31.37 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  31.67 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 281 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  33.2 
 
 		 248 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  28.83 
 
 		 787 aa  93.2  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  28.2 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  30.11 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  26.71 
 
 		 600 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  29.63 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  28.7 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  28.32 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  28.4 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  23.99 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  29.9 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  26.14 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.36 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  24.83 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  27.73 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0073  hypothetical protein  30.43 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.56225e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  26.67 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48279  predicted protein  29.73 
 
 		 839 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48287  predicted protein  29.73 
 
 		 839 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44250  predicted protein  30.95 
 
 		 871 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  31.68 
 
 		 340 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  28.57 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  30.69 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  30.09 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3179  hypothetical protein  27.38 
 
 		 328 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 677 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3927  hypothetical protein  24.48 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.718732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1521  hypothetical protein  28.69 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2953  hypothetical protein  26.05 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  30.85 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1512  hypothetical protein  30.43 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  25.83 
 
 		 338 aa  44.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0220  hypothetical protein  31.58 
 
 		 336 aa  43.9  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>