16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1771 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.79 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  30.84 
 
 		 614 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  30.93 
 
 		 787 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  31.32 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  31.41 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  27.22 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  27.53 
 
 		 320 aa  85.9  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  28.19 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  25.23 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  27.78 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  25.4 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  23.83 
 
 		 600 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  26.51 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  25.7 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>