31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4855 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  709    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  38.77 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  35.05 
 
 		 416 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  32.32 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  30.03 
 
 		 787 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  29.59 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  30.6 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  36.32 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  36.64 
 
 		 600 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  31.09 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  29.03 
 
 		 614 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.92 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  29.1 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  27.03 
 
 		 248 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  31.97 
 
 		 314 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  33.01 
 
 		 314 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 281 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  32.21 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  27.38 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  25.65 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  25.73 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  26.36 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  26.35 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  28.19 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  49.21 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  20.46 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3269  hypothetical protein  33.07 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.706485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48279  predicted protein  31.5 
 
 		 839 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48287  predicted protein  31.5 
 
 		 839 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  29.9 
 
 		 472 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>