20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1591 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  97.77 
 
 		 314 aa  540  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  72.93 
 
 		 312 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  31.97 
 
 		 349 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  29.47 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  34.55 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  25.81 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  31.33 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  29.63 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  29.22 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  25.36 
 
 		 412 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  42 
 
 		 787 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  23.16 
 
 		 401 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.62 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  23.65 
 
 		 465 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  40.74 
 
 		 600 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  24.87 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  28.07 
 
 		 472 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>