31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2772 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  855    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  38.89 
 
 
401 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  31.68 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  32.2 
 
 
248 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  30.77 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  36.32 
 
 
349 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
281 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  31.25 
 
 
328 aa  97.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  29.44 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  29.7 
 
 
461 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  28.19 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  27.35 
 
 
600 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  25.24 
 
 
312 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  31.14 
 
 
320 aa  60.1  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  24.91 
 
 
333 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  25.59 
 
 
314 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.15 
 
 
377 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  25.36 
 
 
314 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  25.18 
 
 
299 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48279  predicted protein  27.35 
 
 
839 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48287  predicted protein  27.35 
 
 
839 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  25.51 
 
 
394 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  22.37 
 
 
787 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  28.44 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  30.61 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  23.26 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44250  predicted protein  28.12 
 
 
871 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.07 
 
 
844 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  29.59 
 
 
340 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>