28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0499 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  687    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  36.81 
 
 		 787 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.7 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  36.79 
 
 		 614 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  32.44 
 
 		 394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  32.33 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  38.77 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  32.97 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  31.41 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  29.21 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  31.35 
 
 		 600 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  29.29 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  28.22 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  29.51 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  28.83 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  25.84 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  25.3 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  24.91 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  29.52 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1591  hypothetical protein  31.33 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1872  hypothetical protein  33.53 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  24.44 
 
 		 465 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  20.58 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  25.2 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  28.43 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  27.35 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>