18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0413 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  742    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1859  hypothetical protein  38.51 
 
 
323 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174959  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  32.99 
 
 
328 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0220  hypothetical protein  30.82 
 
 
336 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  30.43 
 
 
340 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  29.33 
 
 
340 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  31.02 
 
 
341 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3579  hypothetical protein  31.69 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512655  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2758  hypothetical protein  31.91 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  31.99 
 
 
330 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0017  hypothetical protein  29.67 
 
 
353 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.129406  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  31.82 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  27.27 
 
 
600 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4162  hypothetical protein  21.39 
 
 
360 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.6055  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  27.35 
 
 
333 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1512  hypothetical protein  34.34 
 
 
303 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.17 
 
 
377 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>