27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1816 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  100 
 
 		 600 aa  1214    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  36.64 
 
 		 349 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  33.89 
 
 		 328 aa  100  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  29.05 
 
 		 787 aa  90.1  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.08 
 
 		 377 aa  88.6  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  31.35 
 
 		 333 aa  87  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  27.53 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  27.34 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  27.08 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  29.34 
 
 		 320 aa  77  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  28.39 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  23.62 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  26.52 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  27.35 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1741  hypothetical protein  24.46 
 
 		 299 aa  62  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0656009  normal  0.258144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  26.61 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  26.83 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  26.72 
 
 		 286 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  32.86 
 
 		 465 aa  53.9  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  28.99 
 
 		 328 aa  52.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  26.62 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  27.27 
 
 		 362 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  33.67 
 
 		 312 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  23.83 
 
 		 313 aa  43.5  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.372685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>