19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3262 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3262  hypothetical protein  100 
 
 
614 aa  1260    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.89048  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3270  hypothetical protein  44.41 
 
 
394 aa  266  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  38.56 
 
 
787 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1774  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.36 
 
 
377 aa  171  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  36.79 
 
 
333 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1771  hypothetical protein  30.84 
 
 
313 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.372685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  32.64 
 
 
320 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3268  hypothetical protein  29.79 
 
 
338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.893529  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  29.03 
 
 
349 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  27.34 
 
 
600 aa  81.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  24.33 
 
 
328 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
281 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  26.24 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  23.26 
 
 
401 aa  61.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
416 aa  61.2  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  24.4 
 
 
304 aa  60.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  25.29 
 
 
248 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  23.64 
 
 
286 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  24.91 
 
 
289 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>