26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0386 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  100 
 
 
465 aa  966    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  33.9 
 
 
461 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  42.07 
 
 
361 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2733  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.76 
 
 
778 aa  85.9  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  33.9 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  28.32 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  30.25 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  28.19 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  35.06 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  24.46 
 
 
286 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  26.78 
 
 
289 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
281 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  24.44 
 
 
333 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  32.86 
 
 
600 aa  53.9  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  30.22 
 
 
818 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0115  protein of unknown function DUF23  22.45 
 
 
401 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2606  hypothetical protein  24.07 
 
 
328 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0836  hypothetical protein  23.23 
 
 
320 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1182  hypothetical protein  31.25 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  24.62 
 
 
787 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1648  hypothetical protein  22.97 
 
 
312 aa  47  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.964426  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3695  hypothetical protein  26.98 
 
 
248 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1997  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.03 
 
 
541 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  30.86 
 
 
425 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>