34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2732 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
361 aa  748    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  45.14 
 
 
461 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2733  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.96 
 
 
778 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  42.07 
 
 
465 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  31.98 
 
 
786 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  42.14 
 
 
509 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  38.46 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0541  methyltransferase FkbM family  32.18 
 
 
739 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  34.48 
 
 
818 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  39.35 
 
 
731 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0602  FkbM family methyltransferase  28.1 
 
 
700 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.621895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1997  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.03 
 
 
541 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  32.32 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  26.53 
 
 
243 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12970  hypothetical protein  31.71 
 
 
243 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1182  hypothetical protein  28.77 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  26.23 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  36.73 
 
 
1171 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0932  methyltransferase FkbM family  33.85 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2169  FkbM family methyltransferase  35.56 
 
 
485 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0869424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4199  methyltransferase FkbM family  27.4 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  27.33 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1079  FkbM family methyltransferase  24.24 
 
 
257 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301839  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1399  methyltransferase FkbM family protein  37.33 
 
 
294 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4876  methyltransferase FkbM family  28.05 
 
 
931 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  27 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4448  methyltransferase FkbM family  40 
 
 
290 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126012  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.06 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  32.89 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2095  methyltransferase FkbM  27.92 
 
 
242 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2462  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.19 
 
 
820 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00583202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.56 
 
 
1448 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4064  FkbM family methyltransferase  28.35 
 
 
237 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  28.17 
 
 
1213 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>