32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4448 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4448  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
290 aa  588  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1263  FkbM family methyltransferase  59.25 
 
 
280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0693378  normal  0.606041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5092  FkbM family methyltransferase  56.44 
 
 
281 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3361  methyltransferase FkbM family  52.19 
 
 
312 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000091762  normal  0.0310728 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2363  methyltransferase FkbM  39.56 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3721  methyltransferase FkbM family  35.22 
 
 
279 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1164  hypothetical protein  30.49 
 
 
280 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.444253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2169  FkbM family methyltransferase  26.72 
 
 
485 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0869424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  27.23 
 
 
1221 aa  79.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.56 
 
 
1415 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0932  methyltransferase FkbM family  29.37 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2115  methyltransferase FkbM family  30.15 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1399  methyltransferase FkbM family protein  31.79 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  34 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  33.11 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  36.72 
 
 
243 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  30.85 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  32.49 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6312  methyltransferase FkbM family  30 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12970  hypothetical protein  28.32 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4064  FkbM family methyltransferase  33.67 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345765  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  31.25 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3133  methyltransferase FkbM family  28.88 
 
 
358 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2095  methyltransferase FkbM  33.14 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  40 
 
 
361 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1157  FkbM family methyltransferase  31.41 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231016  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0800  FkbM family methyltransferase  25.17 
 
 
395 aa  45.8  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0695  hypothetical protein  25.17 
 
 
395 aa  45.8  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.86421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  27.63 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0541  methyltransferase FkbM family  33.9 
 
 
739 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4876  methyltransferase FkbM family  30.89 
 
 
931 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541495  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  31.51 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>