38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3721 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3721  methyltransferase FkbM family  100 
 
 		 279 aa  579  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1263  FkbM family methyltransferase  36.82 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0693378  normal  0.606041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5092  FkbM family methyltransferase  35.77 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4448  methyltransferase FkbM family  35.22 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3361  methyltransferase FkbM family  34.4 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000091762  normal  0.0310728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1164  hypothetical protein  32.44 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.444253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2169  FkbM family methyltransferase  34.36 
 
 		 485 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0869424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2363  methyltransferase FkbM  30.83 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2115  methyltransferase FkbM family  32.16 
 
 		 333 aa  98.6  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0932  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 		 319 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1399  methyltransferase FkbM family protein  35.05 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  23.69 
 
 		 1221 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0695  hypothetical protein  32.14 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.86421  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0800  FkbM family methyltransferase  32.14 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  28.11 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  28.11 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  20.75 
 
 		 1415 aa  58.9  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  29.87 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  27.07 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  29.17 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3364  hypothetical protein  25.42 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  26.63 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1157  FkbM family methyltransferase  27.97 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0541  methyltransferase FkbM family  35 
 
 		 739 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2342  FkbM family methyltransferase  38.71 
 
 		 681 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4064  FkbM family methyltransferase  29.69 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  26.55 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  36.84 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12970  hypothetical protein  27.16 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2095  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2219  methyltransferase FkbM family  37.5 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  32.74 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  28.92 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  32.88 
 
 		 316 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  27.15 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0602  FkbM family methyltransferase  27.52 
 
 		 700 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.621895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1770  hypothetical protein  23.53 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.328373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4876  methyltransferase FkbM family  31.46 
 
 		 931 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>