29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4094 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  750    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  28.98 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0412  hypothetical protein  27.64 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.862178  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  28.76 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  29.06 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  28.9 
 
 		 322 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0333  hypothetical protein  24.66 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4426  hypothetical protein  26.52 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  26.09 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  28.93 
 
 		 661 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  24.09 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  26.69 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1088 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  24.88 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  23.32 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  23.83 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  27.27 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  23.36 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  25.41 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1448  hypothetical protein  28.02 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  24.18 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  25.32 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0532  hypothetical protein  25.36 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.31 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  25.98 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  46.34 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0508  hypothetical protein  23.35 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387565  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  28.22 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0014  hypothetical protein  45.71 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869851  normal  0.147049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>