23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5028 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  698    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  25.94 
 
 		 661 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  27.3 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  28.1 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  27.31 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  25.94 
 
 		 333 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  26.76 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0412  hypothetical protein  26.17 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.862178  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  28.27 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  23.53 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  25.44 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  24.58 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  25.74 
 
 		 422 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0333  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1088 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0697  hypothetical protein  26.23 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0716574  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2562  hypothetical protein  27 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4088  hypothetical protein  25.34 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00189441  normal  0.318027 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3919  hypothetical protein  25.34 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4426  hypothetical protein  27.36 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  21.37 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  25.46 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>