18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1453 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  703    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  38.84 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  36.39 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  35.99 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  32.47 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0152  hypothetical protein  34.5 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1455  hypothetical protein  32.49 
 
 		 343 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1448  hypothetical protein  34.47 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0633  hypothetical protein  29.88 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4418  hypothetical protein  28.27 
 
 		 372 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  24.32 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  30.41 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3865  hypothetical protein  28.06 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  23.56 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  20.31 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0151  hypothetical protein  32.37 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  23.84 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  25.65 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>