23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3925 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  720    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4088  hypothetical protein  32.23 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00189441  normal  0.318027 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3919  hypothetical protein  32.23 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  29.23 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  25.38 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  25.52 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  33.75 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0697  hypothetical protein  25.2 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0716574  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  28.27 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  29.3 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  30.63 
 
 		 382 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4383  hypothetical protein  20.07 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0780096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  24.22 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  30.41 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  29.78 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  25.82 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0152  hypothetical protein  26.74 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  26.22 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1606  hypothetical protein  25.09 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0457  hypothetical protein  48.72 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  27.66 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  30.32 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0014  hypothetical protein  30.14 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869851  normal  0.147049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>