14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00972 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  916    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  33.2 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3210  hypothetical protein  26.72 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  26.11 
 
 		 318 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  31.85 
 
 		 324 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  26.17 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  31.65 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0510  hypothetical protein  34.11 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  29.77 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  26.09 
 
 		 274 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  25.68 
 
 		 298 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1606  hypothetical protein  46.34 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  46.34 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  23.38 
 
 		 389 aa  43.1  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>