17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1237 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  617  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  25.55 
 
 
364 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  25.27 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  24.89 
 
 
370 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  21.12 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  27.84 
 
 
1088 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  25.68 
 
 
447 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  23.71 
 
 
398 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0333  hypothetical protein  25 
 
 
399 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2447  hypothetical protein  23.38 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.81 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  22.11 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  24.4 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  25.46 
 
 
336 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4426  hypothetical protein  22.07 
 
 
385 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0014  hypothetical protein  29.36 
 
 
367 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869851  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  23.76 
 
 
365 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>