16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2391 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0333  hypothetical protein  44.88 
 
 
399 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4426  hypothetical protein  45.43 
 
 
385 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  26.34 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  24.84 
 
 
322 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  25.38 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  24.77 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  24.58 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  24.26 
 
 
346 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  24.92 
 
 
1088 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  25.71 
 
 
661 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.74 
 
 
333 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1606  hypothetical protein  19.42 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  28.93 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  23.24 
 
 
324 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  22.04 
 
 
398 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>