14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2166 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  790    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0510  hypothetical protein  47.68 
 
 
388 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0633  hypothetical protein  26.21 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  29.61 
 
 
422 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3210  hypothetical protein  29.32 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  28.92 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  23.31 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  33.09 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  29.7 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  28.93 
 
 
370 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  28.3 
 
 
322 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.27 
 
 
333 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  24.65 
 
 
431 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  22.66 
 
 
447 aa  43.1  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>