14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3986 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3986  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.077735  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  81.93 
 
 
333 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2562  hypothetical protein  31 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1606  hypothetical protein  25.72 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  26.73 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  31.29 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  27.21 
 
 
389 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0510  hypothetical protein  28.29 
 
 
388 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3208  hypothetical protein  27.21 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  26.71 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2391  hypothetical protein  28 
 
 
370 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1455  hypothetical protein  38.6 
 
 
343 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  24.5 
 
 
274 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>