272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0287 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
319 aa  647    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  37.45 
 
 
373 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 
659 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
659 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
660 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  29.84 
 
 
624 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 
673 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 
280 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  29.44 
 
 
724 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 
349 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
282 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 
628 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 
712 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  30.92 
 
 
273 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 
712 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
254 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 
321 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  30.52 
 
 
273 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  30.52 
 
 
273 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  32.3 
 
 
363 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  27.31 
 
 
672 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 
234 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  27.31 
 
 
672 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
672 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  27.31 
 
 
672 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  27.31 
 
 
672 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  27.31 
 
 
672 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
336 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  27.31 
 
 
672 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  28.98 
 
 
671 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  28.93 
 
 
273 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  28.87 
 
 
671 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  30.8 
 
 
256 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
510 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 
348 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 
279 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  29.52 
 
 
256 aa  99.4  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 
278 aa  99  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  25.56 
 
 
391 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  25.44 
 
 
673 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  25.44 
 
 
673 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
255 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  25.44 
 
 
673 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  27.54 
 
 
273 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.84 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  29.54 
 
 
640 aa  96.3  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 
276 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  25.54 
 
 
366 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 
695 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
348 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  26.76 
 
 
348 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  25.31 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
348 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 
354 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
348 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
348 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30.28 
 
 
373 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 
274 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 
271 aa  92.8  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
348 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
284 aa  92.4  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 
224 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  31.15 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 
276 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 
264 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 
370 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  28.23 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
697 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.38 
 
 
258 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
697 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.51 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 
697 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  26.36 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  25.36 
 
 
684 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 
262 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  25.51 
 
 
273 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  29.24 
 
 
266 aa  87  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 
697 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 
697 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  25.51 
 
 
273 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.11 
 
 
237 aa  86.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  22.86 
 
 
665 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.51 
 
 
273 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  24.2 
 
 
698 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  29.55 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  29.55 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
645 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>