81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0249 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 370 aa  753    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  65.06 
 
 		 359 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  62.82 
 
 		 357 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  66.38 
 
 		 360 aa  461  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  61.65 
 
 		 371 aa  455  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  60.51 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  58.03 
 
 		 364 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  54.24 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.59 
 
 		 691 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.21 
 
 		 685 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.84 
 
 		 681 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  44.32 
 
 		 728 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.39 
 
 		 685 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  44.03 
 
 		 728 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  38.23 
 
 		 689 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  38.04 
 
 		 720 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  37.5 
 
 		 707 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  38.8 
 
 		 684 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  37.23 
 
 		 707 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  35.68 
 
 		 710 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  34.4 
 
 		 574 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  35.17 
 
 		 556 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  29.89 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  31.96 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  31.68 
 
 		 845 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  43.41 
 
 		 955 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  42.07 
 
 		 891 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  32.35 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  28.7 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  31.12 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  27.93 
 
 		 957 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 		 339 aa  119  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  28.48 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  27.51 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  27.51 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  29.43 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  28.41 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  27.57 
 
 		 959 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  29.5 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  28.04 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  29.14 
 
 		 346 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  28.06 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  27.24 
 
 		 956 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  30.26 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  29.14 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  30.3 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  31.35 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2005  hypothetical protein  22.65 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375654  normal  0.0926262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  23.87 
 
 		 4101 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4755  hypothetical protein  22.65 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.0689026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0942  glutamyl-tRNA reductase  32.74 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 260 aa  49.3  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  30.36 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  35.14 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3752  glutamyl-tRNA reductase  34.48 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  26.86 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  26.86 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  26.86 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  23.2 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  23.2 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.511264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  23.32 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03645  glutamyl-tRNA reductase  29.75 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  30.09 
 
 		 455 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 264 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  29.2 
 
 		 456 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 		 252 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2478  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.74 
 
 		 264 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26403  predicted protein  24.91 
 
 		 621 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00293247  decreased coverage  0.00469523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7138  short chain dehydrogenase  27.72 
 
 		 260 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1864  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.38 
 
 		 262 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 263 aa  42.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 260 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 265 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  29.73 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  29.73 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>