More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1435 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
299 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.44 
 
 
370 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  33.88 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.51 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.5 
 
 
371 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.5 
 
 
371 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 
280 aa  85.5  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
284 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
309 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
370 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.1 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.8 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.8 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
284 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  32.64 
 
 
269 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.53 
 
 
371 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  31.56 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.89 
 
 
371 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.05 
 
 
370 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.85 
 
 
370 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.4 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.87 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.95 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  26.94 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.95 
 
 
368 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 
261 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  33.15 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.13 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.12 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.95 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.56 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.67 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  29.05 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  27.84 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.12 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.5 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  26.12 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.38 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  25.71 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>