240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0344 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
290 aa  597  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  55.71 
 
 
297 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  54.67 
 
 
297 aa  335  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  56.51 
 
 
294 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  55.82 
 
 
294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  56.85 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  57.88 
 
 
295 aa  319  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  55.82 
 
 
294 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  56.85 
 
 
309 aa  318  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  55.82 
 
 
294 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  56.16 
 
 
309 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  56.16 
 
 
309 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  56.51 
 
 
309 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  57.19 
 
 
295 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  56.51 
 
 
309 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  56.51 
 
 
309 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  56.51 
 
 
309 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  56.51 
 
 
309 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  56.51 
 
 
309 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  53.1 
 
 
293 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  56.51 
 
 
309 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  56.16 
 
 
309 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  56.36 
 
 
295 aa  316  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  56.16 
 
 
309 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  56.16 
 
 
309 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  56.16 
 
 
309 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  56.16 
 
 
309 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  56.16 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  55.48 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  55.48 
 
 
312 aa  311  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  54.55 
 
 
299 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  53.08 
 
 
295 aa  304  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  55.14 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  54.11 
 
 
294 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  53.77 
 
 
294 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  52.58 
 
 
293 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  47.06 
 
 
298 aa  289  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  49.48 
 
 
293 aa  288  6e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  52.56 
 
 
300 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  52.53 
 
 
305 aa  285  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  52.22 
 
 
300 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  51.54 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  50.34 
 
 
303 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  52.96 
 
 
311 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  46.21 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  47.95 
 
 
301 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  49.15 
 
 
305 aa  265  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  45.79 
 
 
297 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  50.34 
 
 
295 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  45.26 
 
 
296 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  46.55 
 
 
291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  44.29 
 
 
304 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  44.1 
 
 
294 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  44.1 
 
 
311 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.76 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  37.72 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  34.03 
 
 
275 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  35.49 
 
 
281 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  34.83 
 
 
293 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.07 
 
 
271 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  34.36 
 
 
293 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  32.49 
 
 
312 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  32.76 
 
 
273 aa  159  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  34.7 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.7 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  33.8 
 
 
273 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  30.06 
 
 
310 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  33.91 
 
 
272 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  33.33 
 
 
272 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  31.25 
 
 
273 aa  149  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  31.25 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  33.02 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  31.21 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  33.02 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  31.23 
 
 
310 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  32.42 
 
 
281 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  32.65 
 
 
453 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  31.96 
 
 
449 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  31.35 
 
 
310 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  31.92 
 
 
321 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  30.9 
 
 
296 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  32.3 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  30.28 
 
 
334 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  33 
 
 
308 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  34.39 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  30.5 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.55 
 
 
305 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  31.33 
 
 
309 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  31.33 
 
 
309 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.06 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  33.54 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  30.6 
 
 
321 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  31.02 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  31.66 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  31.75 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  32.18 
 
 
310 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  31.75 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  28.84 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  29.65 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>