More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0625 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 357 aa  727    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  45.96 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  45.99 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  46.25 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  43.41 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  45.43 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  41.88 
 
 		 376 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  43.28 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 		 339 aa  245  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  40.43 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  40.68 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  40.27 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  41.69 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  46.32 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  42.68 
 
 		 389 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  43.67 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  43.35 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  44.37 
 
 		 343 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  40.18 
 
 		 332 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  43.13 
 
 		 620 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  45.11 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  40.06 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  38.35 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  38.72 
 
 		 456 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  42.3 
 
 		 355 aa  215  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  35.01 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  42.47 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  43.43 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  42 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 344 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  40.27 
 
 		 355 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  36.22 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  38.37 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  38.13 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  40.54 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  42.18 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  38.13 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  41.16 
 
 		 377 aa  206  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  38.03 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  39.02 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  39.26 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  40.07 
 
 		 349 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  39.26 
 
 		 345 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 335 aa  202  9e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  39.26 
 
 		 345 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 467 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  38.96 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  39.17 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  39.02 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  39.02 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  38.92 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 314 aa  200  3.9999999999999996e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  37.39 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  36.98 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  38.92 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  40.34 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  37.99 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 464 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  39.13 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  37.76 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  39.13 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.2 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  40.12 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  37.13 
 
 		 414 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  37.79 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  38.18 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  39.13 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  41.07 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  41.28 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  40.86 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  37.13 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.88 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  41.92 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  38.72 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  37.65 
 
 		 579 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  39.06 
 
 		 599 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  38.8 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  35.98 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  38.06 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  38.48 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  38.41 
 
 		 333 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 		 328 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  38.44 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  40.31 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  39.19 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>