More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4012 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  60.64 
 
 		 191 aa  244  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  62.11 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 		 190 aa  239  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  61.17 
 
 		 193 aa  238  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  57.07 
 
 		 188 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  54.26 
 
 		 190 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  51.04 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 193 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 187 aa  218  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 187 aa  218  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 		 189 aa  214  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  58.7 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  56.84 
 
 		 189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  54.89 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 		 188 aa  210  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 195 aa  207  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  48.02 
 
 		 195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  54.35 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  49.23 
 
 		 195 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 		 191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  49.74 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  48.44 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  48.63 
 
 		 190 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  45.6 
 
 		 192 aa  174  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  46.23 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  49.74 
 
 		 196 aa  174  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  44.32 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  44.89 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  48.13 
 
 		 196 aa  165  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  45.08 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  41.75 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  43.08 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  41.97 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  43.08 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  41.97 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  44.22 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  45.13 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  41.49 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  32.96 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 		 173 aa  72  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  37.39 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3487  orotate phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  29.78 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001826  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3843  orotate phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00649  orotate phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0528  orotate phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.560571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0321  orotate phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.23 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2485  orotate phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  32.14 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3835  orotate phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3478  orotate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.972793  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0379  orotate phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0113  orotate phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>