More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2116 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 338 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  45.77 
 
 		 341 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  44.9 
 
 		 339 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  44.64 
 
 		 339 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  44.64 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  44.35 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  44.35 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  44.35 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  44.06 
 
 		 339 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  44.35 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  45.19 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  32.88 
 
 		 365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.98 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  34.62 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  33.23 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 241 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  37 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  37 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  34.46 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  27.54 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.72 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.59 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  36.57 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  36.72 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  34.54 
 
 		 241 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  33.73 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.49 
 
 		 243 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  36 
 
 		 240 aa  99.4  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.28 
 
 		 384 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.59 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  25.54 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 371 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 245 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  26.88 
 
 		 378 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.04 
 
 		 380 aa  96.3  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25.48 
 
 		 382 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  33.66 
 
 		 247 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  26.81 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.87 
 
 		 382 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  25.41 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  32.95 
 
 		 522 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.07 
 
 		 365 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 378 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  30.77 
 
 		 226 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  32.5 
 
 		 226 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 369 aa  89.4  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  28.38 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 245 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 375 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  28.35 
 
 		 251 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  33.13 
 
 		 245 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  24.92 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  27.25 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  25.67 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.16 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  32.18 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.18 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  21.62 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  25.68 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  22.43 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  26 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  23.24 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  25.33 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.5 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  23.91 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  25.34 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  26.18 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.78 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  24.8 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  23.3 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  23.24 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  25.28 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  21.4 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  25.45 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  26.6 
 
 		 691 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>