More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1178 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  100 
 
 		 452 aa  931    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.6 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  36.32 
 
 		 449 aa  293  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  37.67 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  36.7 
 
 		 453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  36.7 
 
 		 453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  36.7 
 
 		 453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  36.7 
 
 		 453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  36.73 
 
 		 448 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  35.7 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.5 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  35.93 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  35.93 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  35.7 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  35.96 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  35.7 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  35.47 
 
 		 453 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  35.47 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  33.63 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.22 
 
 		 494 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  34.42 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  36.18 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  33.77 
 
 		 449 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  34.26 
 
 		 443 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  34.43 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  35.5 
 
 		 457 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  33.48 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  33.18 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.51 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  34.46 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  33.7 
 
 		 447 aa  243  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  34.99 
 
 		 447 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  34.4 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  32.27 
 
 		 503 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  31.7 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  30.98 
 
 		 448 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  35.12 
 
 		 472 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  31.95 
 
 		 480 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  32.13 
 
 		 467 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  30.56 
 
 		 477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  32.51 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  29.98 
 
 		 485 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  29.76 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  33 
 
 		 473 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  29.98 
 
 		 485 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  30.66 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  29.41 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  32.39 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  29.96 
 
 		 454 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  31.08 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  30.07 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  34.98 
 
 		 569 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  31.26 
 
 		 457 aa  200  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  31.55 
 
 		 464 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  29.87 
 
 		 464 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  32.01 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  28.85 
 
 		 470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  31.73 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  30.34 
 
 		 475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  31.7 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  30.75 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.09 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  31.58 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  30.82 
 
 		 478 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  31.63 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  30.7 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  29.61 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  30.7 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  30.4 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  29.26 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  30 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.47 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  29.72 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  29.72 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  29.3 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  30.18 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  29.09 
 
 		 474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  29.34 
 
 		 466 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  31.14 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  29.72 
 
 		 489 aa  190  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  29.27 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.63 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  29.42 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  28.57 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  30.11 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  31.4 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  30.96 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  33.71 
 
 		 425 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  31.72 
 
 		 471 aa  187  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  31.15 
 
 		 445 aa  186  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.98 
 
 		 425 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  31.6 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  27.31 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.88 
 
 		 425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2641  amidohydrolase  30.46 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  28.42 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  29.65 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  29.03 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  30.48 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  31.19 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>