More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0331 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0331  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
542 aa  1124    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  44.94 
 
 
533 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2550  extracellular solute-binding protein family 5  39.48 
 
 
523 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00133049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  35.39 
 
 
544 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0035  extracellular solute-binding protein family 5  37.35 
 
 
546 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000195087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1345  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  38.24 
 
 
552 aa  315  9e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.932628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3066  extracellular solute-binding protein family 5  32.41 
 
 
547 aa  294  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1329  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  33.09 
 
 
532 aa  292  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  30.73 
 
 
549 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0187  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.79 
 
 
542 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1465  extracellular solute-binding protein family 5  32.07 
 
 
541 aa  258  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0011  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 
534 aa  252  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0146567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1675  oligopeptide-binding protein OppA  31.36 
 
 
512 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642155  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3644  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
510 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1361  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  29.22 
 
 
544 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0151112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1376  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  29.37 
 
 
544 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.268389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1071  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.65 
 
 
525 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0509495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1125  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 
525 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0107082  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1345  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  30.32 
 
 
544 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2106  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  29.19 
 
 
544 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1925  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.32 
 
 
544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3547  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  30.44 
 
 
515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000727174  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0216  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
569 aa  219  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 
509 aa  194  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.26 
 
 
518 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
526 aa  176  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 
519 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28 
 
 
511 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.76 
 
 
524 aa  156  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.76 
 
 
511 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.95 
 
 
538 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
508 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.33 
 
 
546 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 
534 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 
533 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
565 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.86 
 
 
524 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  29.73 
 
 
562 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  24.47 
 
 
510 aa  143  9e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  22.56 
 
 
540 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04010  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.79 
 
 
548 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115797  normal  0.0514058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
539 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
559 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0119  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
532 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.33 
 
 
511 aa  136  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 
510 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4500  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1971  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.743088  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 
517 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
528 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.34 
 
 
575 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 
551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  22.17 
 
 
576 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.4 
 
 
542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.27 
 
 
555 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.91 
 
 
575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 
575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  26.27 
 
 
532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 
534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.91 
 
 
575 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  26.01 
 
 
575 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.59 
 
 
559 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  26.01 
 
 
575 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  27.79 
 
 
518 aa  127  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.19 
 
 
545 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 
575 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.45 
 
 
524 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.45 
 
 
524 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
594 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  28.45 
 
 
524 aa  126  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  28.45 
 
 
524 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 
622 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  28.45 
 
 
524 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  22.62 
 
 
563 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  28.18 
 
 
524 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  28.45 
 
 
524 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.46 
 
 
511 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.81 
 
 
524 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.54 
 
 
505 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.81 
 
 
524 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.78 
 
 
510 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.67 
 
 
520 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
595 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
567 aa  123  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.7 
 
 
515 aa  123  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
618 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.78 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5439  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.78 
 
 
566 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  22.66 
 
 
579 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  21.34 
 
 
557 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.25 
 
 
535 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>