215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2642 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2642  ExoP-related protein  100 
 
 
521 aa  1014    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0342  protein-tyrosine kinase  30.65 
 
 
554 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0461311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  27.22 
 
 
734 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.47 
 
 
736 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  29.45 
 
 
521 aa  77.4  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  30.74 
 
 
529 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.15 
 
 
575 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  28.51 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.58 
 
 
720 aa  70.5  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  26.13 
 
 
492 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  30.54 
 
 
735 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25.57 
 
 
747 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  26.69 
 
 
743 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.54 
 
 
735 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.12 
 
 
482 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  26.53 
 
 
741 aa  67  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  24.55 
 
 
731 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  22.97 
 
 
720 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  25.26 
 
 
667 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  23.36 
 
 
464 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  22.89 
 
 
790 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  27.35 
 
 
711 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  22.97 
 
 
720 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  22.67 
 
 
720 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  22.67 
 
 
720 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  22.19 
 
 
724 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  27.83 
 
 
734 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.93 
 
 
737 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  22.67 
 
 
720 aa  63.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  22.38 
 
 
720 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.92 
 
 
790 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  25.48 
 
 
726 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  27.5 
 
 
763 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.06 
 
 
228 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.06 
 
 
228 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.6 
 
 
726 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.66 
 
 
750 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.33 
 
 
741 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  27.74 
 
 
755 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.19 
 
 
742 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  27.62 
 
 
766 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.64 
 
 
220 aa  60.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 
751 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  24.2 
 
 
726 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  25.73 
 
 
751 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.2 
 
 
726 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.2 
 
 
726 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  22.38 
 
 
720 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.2 
 
 
726 aa  60.1  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.2 
 
 
726 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  22.38 
 
 
720 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.2 
 
 
726 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.2 
 
 
726 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  24.2 
 
 
726 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
751 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
804 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  25.59 
 
 
739 aa  59.3  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  27.85 
 
 
755 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  30.99 
 
 
784 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  30.68 
 
 
784 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  26.7 
 
 
257 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4219  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 
685 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  25.48 
 
 
229 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  25.95 
 
 
734 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  27.78 
 
 
225 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  22.64 
 
 
759 aa  57.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.07 
 
 
800 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  24.63 
 
 
740 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  22.58 
 
 
252 aa  57.8  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.26 
 
 
240 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  28.93 
 
 
803 aa  57.4  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.2 
 
 
730 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  21.51 
 
 
719 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  23.1 
 
 
723 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  27.38 
 
 
225 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  27.98 
 
 
225 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  22.83 
 
 
735 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.35 
 
 
733 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.16 
 
 
230 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.16 
 
 
230 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  21.51 
 
 
719 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.03 
 
 
739 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  21.51 
 
 
719 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  26.56 
 
 
803 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  21.51 
 
 
719 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  21.51 
 
 
719 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  22.29 
 
 
753 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  33.54 
 
 
745 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  30.91 
 
 
795 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  26.34 
 
 
239 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.66 
 
 
721 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  31.55 
 
 
211 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  26.06 
 
 
257 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.6 
 
 
726 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
731 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  21.83 
 
 
708 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.89 
 
 
780 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  27.89 
 
 
781 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  28.65 
 
 
233 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.43 
 
 
454 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>