102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1985 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 224 aa  431  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  22.94 
 
 		 269 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  29.76 
 
 		 288 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  27.08 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 278 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  26.36 
 
 		 278 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  26.36 
 
 		 278 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  26.36 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  26.36 
 
 		 278 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 278 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  26.36 
 
 		 278 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  26.36 
 
 		 278 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  26.25 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  24.56 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  33.62 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  25.76 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  25.33 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  25.11 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  25.33 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  24.89 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  24.89 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  32.34 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  32.34 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  24.89 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  31.17 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  24.89 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  24.02 
 
 		 261 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  27.2 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  37 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  27.74 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  29.81 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  28 
 
 		 270 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  32.69 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  31.47 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  38.55 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  25.19 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  25.19 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  25.49 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  25.19 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  37.19 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  25.29 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  32.84 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  41.67 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  25.49 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  39.02 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  41.1 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  30.53 
 
 		 119 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  29.45 
 
 		 344 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  24.84 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  24.43 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  24.43 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  32.77 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  29.07 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  41.27 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  28.93 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  26.22 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  39.51 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  24.18 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  31.25 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  30.22 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  36.63 
 
 		 261 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  25.61 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  37.88 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  27.91 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 357 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  29.71 
 
 		 262 aa  48.5  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  53.85 
 
 		 262 aa  48.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  38.33 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  27.14 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  35.94 
 
 		 373 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  24.44 
 
 		 354 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  30.16 
 
 		 264 aa  45.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 267 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  24.8 
 
 		 350 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  27.91 
 
 		 290 aa  45.1  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  33.78 
 
 		 267 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  49.06 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  42.11 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  38.33 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  35.25 
 
 		 345 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  40.38 
 
 		 355 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  25.29 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  37.1 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  23.13 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>