157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1617 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  100 
 
 		 234 aa  441  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.42 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  29.77 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.92 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  29.91 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  29.91 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  29.39 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  29.91 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  29.91 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  29.91 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.91 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  29.91 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  29.39 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  44.55 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  33.88 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  29.49 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  31.02 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  27.6 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  27.6 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  34.21 
 
 		 730 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  30.27 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  37.14 
 
 		 714 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  29.44 
 
 		 738 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  41.53 
 
 		 746 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  37.71 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  31.94 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  27.81 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  28.47 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  33.7 
 
 		 714 aa  65.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  36.52 
 
 		 717 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  31.54 
 
 		 720 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.06 
 
 		 713 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  38.89 
 
 		 732 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  27.54 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  38.89 
 
 		 732 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  42.86 
 
 		 728 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  42.86 
 
 		 728 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  38.89 
 
 		 732 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  30.77 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  32.14 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  35.75 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  34.26 
 
 		 714 aa  58.9  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  38.71 
 
 		 739 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  38.71 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  36.84 
 
 		 735 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  31.03 
 
 		 735 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  27.73 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03390  hypothetical protein  30.97 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  30.05 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  28.99 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.98 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  31.75 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 		 160 aa  52.8  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.15 
 
 		 701 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  28.19 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  31.15 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  24.68 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  36.7 
 
 		 282 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  36.7 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  34.46 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  28.48 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.86 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  32.59 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2616  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  28.85 
 
 		 159 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  24.43 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.41 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  34.86 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  22.39 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  31.91 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  23.88 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  22.96 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.29 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  26.39 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  32.14 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  28.26 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  25.34 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  18.95 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  27.27 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  27.59 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  32.88 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  26.88 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.37 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  30.25 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  28.72 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>