More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1526 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 		 390 aa  805    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  58.99 
 
 		 379 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  55 
 
 		 380 aa  418  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  50.67 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  46.61 
 
 		 386 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  46.61 
 
 		 386 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  49.47 
 
 		 372 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  48.4 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.59 
 
 		 378 aa  342  5e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  46.63 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  44.44 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  44.44 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  43.8 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  44.05 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.9 
 
 		 397 aa  338  9e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  46.35 
 
 		 386 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  45.12 
 
 		 373 aa  335  7.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  44.06 
 
 		 375 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  45.38 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  44.59 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.97 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  43.8 
 
 		 375 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  44.74 
 
 		 386 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  46.61 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  46.61 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  46.61 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  46.61 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  44.3 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  44.3 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.67 
 
 		 382 aa  329  6e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  46.79 
 
 		 371 aa  328  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  46.79 
 
 		 371 aa  328  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  46.79 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  46.79 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.74 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  46.79 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  47.06 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  43.54 
 
 		 391 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  43.8 
 
 		 396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  43.54 
 
 		 397 aa  323  4e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.36 
 
 		 379 aa  323  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  43.56 
 
 		 381 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  42.74 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.53 
 
 		 380 aa  320  3.9999999999999996e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  43.3 
 
 		 381 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  43.41 
 
 		 381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  43.41 
 
 		 381 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  42.05 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  45.16 
 
 		 374 aa  318  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  43.27 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.42 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.74 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  41.95 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.42 
 
 		 382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  40.38 
 
 		 375 aa  305  6e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.98 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.98 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.31 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  43.12 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  41.27 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.09 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.55 
 
 		 409 aa  293  4e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  40.6 
 
 		 412 aa  292  6e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  43.67 
 
 		 373 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  38.95 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  42.97 
 
 		 380 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  40.16 
 
 		 375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  40.16 
 
 		 375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  39.73 
 
 		 375 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.63 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  41.98 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.95 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  40.16 
 
 		 375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  41.79 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.08 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  39.08 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  38.81 
 
 		 374 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.32 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  38.99 
 
 		 395 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  39.35 
 
 		 375 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.69 
 
 		 377 aa  282  7.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  38.81 
 
 		 375 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  42.48 
 
 		 473 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.08 
 
 		 374 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  38.81 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.81 
 
 		 374 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.49 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.81 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  39.08 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.43 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  39.08 
 
 		 373 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  39.19 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  39.19 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  39.19 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  39.08 
 
 		 373 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.01 
 
 		 374 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  39.19 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  38.81 
 
 		 373 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  38.81 
 
 		 373 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  39.35 
 
 		 378 aa  275  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>