More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0138 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  56.15 
 
 
183 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
190 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  46.49 
 
 
189 aa  168  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
201 aa  154  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 
191 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  44.26 
 
 
190 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 
190 aa  147  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  42.08 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  42.08 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 
194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
196 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
202 aa  142  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  41.85 
 
 
196 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  38.38 
 
 
195 aa  141  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 
195 aa  141  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  43.5 
 
 
191 aa  140  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 
193 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  40.43 
 
 
202 aa  136  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 
202 aa  135  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
202 aa  135  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 
202 aa  135  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
191 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
194 aa  134  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  47.52 
 
 
191 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 
196 aa  132  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
192 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
192 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
196 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 
187 aa  132  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  40.53 
 
 
193 aa  131  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 
187 aa  132  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
202 aa  131  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
202 aa  131  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 
195 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  40.22 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
189 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  34.24 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 
192 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 
187 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
188 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
187 aa  123  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
196 aa  123  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
191 aa  121  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 
193 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
202 aa  118  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
195 aa  117  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 
196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  33.15 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
200 aa  115  5e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 
196 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
192 aa  114  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
195 aa  112  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
193 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  32.96 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  32.96 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
206 aa  100  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  26.16 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
170 aa  62  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
187 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
232 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 
195 aa  58.2  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  25.58 
 
 
185 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>