82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5801 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 425 aa  863    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  41.63 
 
 		 428 aa  354  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  33.26 
 
 		 427 aa  252  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  32.64 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  28.4 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  27.88 
 
 		 383 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  25.06 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  22.19 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.89 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  22.89 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  26.62 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  21.46 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  21.78 
 
 		 449 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.08 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  24.03 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.96 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  22.05 
 
 		 356 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  23.81 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  20.85 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.7 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  22.73 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  21.48 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  21.63 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  26.26 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  22.73 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  21.48 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  19.75 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  24.68 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.35 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  24.73 
 
 		 278 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  24.03 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  20.24 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  20.79 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.04 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  22.33 
 
 		 911 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.59 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  21.14 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  19.19 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2899  hypothetical protein  22.03 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0941072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  20.64 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.49 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  21.96 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 245 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  22.46 
 
 		 943 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 283 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  20.9 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 257 aa  47  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  21.27 
 
 		 379 aa  47  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  24.03 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  24.03 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  24.03 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  24.03 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  21.71 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.21 
 
 		 257 aa  45.8  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 281 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 358 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  21.13 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  19.7 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>