More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5138 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5138  Chorismate binding-like protein  100 
 
 		 415 aa  853    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0770  Chorismate binding-like protein  44.26 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1758  isochorismate synthase  35.58 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0818016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4718  isochorismate synthase  36.1 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1525  isochorismate synthase, putative  41.43 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376794 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09908  possible isochorismate synthase  35.64 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0924812  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1774  isochorismate synthase  34.34 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00644261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  33.1 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  29.86 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  30.91 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  32.65 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  29.7 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  29.33 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  29.33 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  30.15 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  30.15 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  30.97 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  30.43 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  30.43 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  28.77 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  30.43 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  30.43 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  30.43 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  30.43 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  28.21 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  30.07 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  29.17 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  30.07 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  30.43 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  30.4 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  28.62 
 
 		 399 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  30.18 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  26.79 
 
 		 465 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  29.41 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  32.14 
 
 		 485 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.11 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  28.29 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  28.62 
 
 		 498 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  29.37 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  27.34 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  29.37 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  26.77 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.45 
 
 		 476 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  29.89 
 
 		 395 aa  99.8  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  29.52 
 
 		 390 aa  99.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  29.47 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  30.29 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  32.22 
 
 		 466 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  29.23 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  27.17 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  29.89 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  28.73 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.18 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  29.04 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  29.04 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  29.04 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  29.04 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  29.04 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0179  isochorismate synthase  24.52 
 
 		 470 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  29.08 
 
 		 445 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  27.53 
 
 		 455 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  31.54 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  27.1 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  27.4 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  29.62 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  29.26 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.28 
 
 		 481 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.6 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.6 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  25.75 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02061  isochorismate synthase  25.37 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  29.85 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  28.17 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  28.17 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  29.46 
 
 		 451 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.96 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.84 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  27.76 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.07 
 
 		 484 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  29.1 
 
 		 452 aa  90.1  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  28.01 
 
 		 495 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.07 
 
 		 484 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.68 
 
 		 464 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.68 
 
 		 464 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.07 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  26.28 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1220  Anthranilate synthase  26.78 
 
 		 515 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.78 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.25 
 
 		 464 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  29.9 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  28.08 
 
 		 465 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1785  anthranilate synthase  26.71 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  30.4 
 
 		 482 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  28.89 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.68 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.47 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  28.52 
 
 		 486 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  25.48 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  30.56 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.41 
 
 		 464 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>