62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2319 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  100 
 
 		 194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  45.45 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  27.37 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  33.55 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  28.66 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  28.26 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  29.67 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  30.05 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  31.33 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  25.34 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  29.33 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  26.14 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  25 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  28.38 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  29.76 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  43.16 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  34.33 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  28.46 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  28.57 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  25.9 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  28.95 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  26.95 
 
 		 421 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  26.03 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  34.83 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  34.52 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  34.52 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  26.9 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  30.36 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  27.15 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  24.52 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  26.87 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  27.63 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  27.15 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  33.33 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  22.3 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  28.57 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  28.93 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  32.61 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  31.43 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  27.78 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.88 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  25.85 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  24.68 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  30.12 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  25.44 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  35.71 
 
 		 213 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  35.71 
 
 		 213 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  26.12 
 
 		 184 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  25 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  25.6 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  34.83 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  25 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  25.58 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  29.17 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  30.12 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  31.33 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  24.71 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  32.1 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>