More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0630 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 374 aa  776    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  56.35 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  52.69 
 
 		 392 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  49.7 
 
 		 344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  48.63 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  44.27 
 
 		 372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  44.93 
 
 		 369 aa  308  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  46.75 
 
 		 369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  41.58 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  42.09 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  42.43 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  47.42 
 
 		 349 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  36.63 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  44.87 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 468 aa  268  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  38.94 
 
 		 458 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  37.64 
 
 		 370 aa  248  9e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  36.87 
 
 		 435 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  37.78 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  36.28 
 
 		 435 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  36.47 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  37.17 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  36.04 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  34.91 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  32.14 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.29 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 357 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 361 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 357 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.86 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  28.46 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  29 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 349 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.86 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  24.85 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  23.97 
 
 		 387 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 347 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 328 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  36.81 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 667 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.86 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  23.92 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  23.67 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  22.85 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  21.86 
 
 		 328 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  25.4 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.6 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  26.48 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  29.1 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  26.48 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.68 
 
 		 335 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  26.32 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.96 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  24.47 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.16 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.6 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>