More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0161 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0161  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3850  response regulator receiver protein  45 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1028  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1952  response regulator receiver  42.02 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121981  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 221 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 225 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 236 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 229 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 236 aa  93.2  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02660  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.71 
 
 		 253 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.646611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 236 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  36.72 
 
 		 243 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 231 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 239 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 231 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 230 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 239 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 235 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 239 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 239 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 239 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 232 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 221 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  40.31 
 
 		 244 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 237 aa  91.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  37.6 
 
 		 232 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 226 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.84 
 
 		 243 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 229 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  37.3 
 
 		 170 aa  90.9  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 233 aa  91.3  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.58 
 
 		 275 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 248 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.8 
 
 		 245 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 251 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 227 aa  90.5  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3706  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322274  normal  0.186621 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 229 aa  90.1  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  37.6 
 
 		 250 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  37.6 
 
 		 238 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  37.6 
 
 		 238 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  37.6 
 
 		 238 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 239 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  37.6 
 
 		 238 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 233 aa  89.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 233 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  37.6 
 
 		 250 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  37.6 
 
 		 250 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 230 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 247 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  36.67 
 
 		 226 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 225 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  39.68 
 
 		 248 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 229 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 243 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 242 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 225 aa  88.6  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 223 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 232 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 242 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  37.6 
 
 		 230 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 222 aa  88.2  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 226 aa  88.6  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  37.6 
 
 		 230 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  36.8 
 
 		 238 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 233 aa  88.2  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  36.8 
 
 		 238 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 228 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  40.65 
 
 		 227 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  37.6 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  37.6 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  37.6 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 234 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 243 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  37.6 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 272 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 243 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 		 230 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 259 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 523 aa  87.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 		 230 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 226 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  35.48 
 
 		 1374 aa  87.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 266 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 262 aa  87.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  38.4 
 
 		 237 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 228 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 238 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.45 
 
 		 236 aa  87  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 227 aa  87.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>