More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1172 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  88.24 
 
 		 121 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  54.7 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  53.33 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  45.92 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  54.29 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  41.57 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  34.31 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  35.79 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  40 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.7 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  52.17 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  37.21 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  42.31 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.84 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  51.02 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  34.59 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  58.97 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  36.59 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.42 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  45.16 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2463  hypothetical protein  29.91 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  61.36 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  61.36 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  31.71 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  32.11 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  37.29 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  54.76 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  66.67 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  61.76 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  32.41 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  40.45 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  41.67 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  35.29 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  39.77 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  45.83 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  54.76 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  54.76 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  51.79 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  54.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  54.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  53.33 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  46.55 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  54.76 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  51.79 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  54.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  54.76 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  31 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  50 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  66.67 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  40.26 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  57.14 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  47.17 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  32.48 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  47.17 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  73.33 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  52.38 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  51.35 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  40 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  54.76 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  55.88 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  31.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  52.38 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  54.55 
 
 		 187 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  55.88 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  50 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  43.1 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  36.51 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  58.82 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  53.06 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  50 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  61.29 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  52.27 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  54.76 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  46.67 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  44.64 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  45.31 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  44.64 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  47.92 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.67 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  31.58 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  65.62 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  60 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  45.45 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  33.75 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  45.45 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  34.48 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  51.35 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  33.75 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  50 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  48.15 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  48.65 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  35.9 
 
 		 353 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>